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阴离子和阳离子聚丙烯酰胺都是聚丙烯酰胺中的一种类型，即都具有高分子有机聚合物性质。这两者在污水处理中多作为絮凝剂使用，但其基理及作用效果都会有所区别。在不同行业或特征的废水处理中的要求及作用效果不同。废水处理用聚丙烯酰胺需要根据现场污水做选型实验确定。聚丙烯酰胺的处理效果好坏主要是看污水中的电荷和聚丙烯酰胺型号吻合度的问题，在于选型的精准度。这和选型范围的多少关系很大，范围越宽、型号越多，则更能选到合适的型号。
一、影响废水处理用聚丙烯酰胺效果的因素：
1、污泥是污水处理中的必然产物，我们应了解污泥来源，性质，成分及固含量。按照污泥含有的主要成分不同，污泥可分为有机污泥和无机污泥。一般来说阳离子聚丙烯酰胺用于处理有机污泥，阴离子聚丙烯酰胺用于处理无机污泥，碱性很强时不易用阳离子聚丙烯酰胺，而酸性很强时不宜用阴离子聚丙烯酰胺，污泥的固含量高时通常聚丙烯酰胺的用量较大。
2、离子度选择：针对所要脱水的污泥，可用不同离子度的絮凝剂通过小实验进行筛选，选出合适的聚丙烯酰胺，这样即可以取得更佳絮凝剂效果，又可使加药量少，节约成本。
3、絮团的大小：絮团太小会影响排水的速度，絮团太大会使絮团束缚较多水而降低泥饼干度。通过选择聚丙烯酰胺的分子量可以调整絮团的大小。
4、絮团的强度：絮团在剪切作用下应保持稳定而不破碎。提高聚丙烯酰胺分子量或者选择合适的分子结构有助于提高絮团稳定性。
5、聚丙烯酰胺与污泥的混合：聚丙烯酰胺在脱水设备的某一位置必须和污泥充分反应，发生絮凝作用。为此，聚丙烯酰胺溶液粘度必须合适，在现有设备条件下能与污泥充分混合，两者混合均匀是否，是成功的关键因素。阳离子聚丙烯酰胺溶液粘度与其分子量和配制浓度有关。
6、阳离子聚丙烯酰胺的溶解：溶解良好才能发充分发挥絮凝作用。有时需要加快溶解速度，这时可考虑提高聚丙烯酰胺溶液的浓度。
二、阴离子絮凝剂的特点及应用
阴离子聚丙烯酰胺对于悬浮颗粒，较粗、浓度高、粒子带阳电荷，水PH值为中性或碱性的污水，由于阴离子聚丙烯酰胺分子链中含有一定量极性基能吸附水中悬浮的固体粒子，使粒子间架桥形成大的絮凝物。因此它加速悬浮液中的粒子的沉降，有非常明显的加快溶液的澄清，促进过滤等效果。阴离子聚丙烯酰胺产品广泛用于化学工业废水、废液的处理，市政污水处理。自来水工业、高浊度水的净化、沉清、洗煤、选矿、冶金、钢铁工业、锌、铝加工业、电子工业等水处理。
三、阳离子絮凝剂的特点及应用
阳离子聚丙烯酰胺却在酸性或碱性介质中均呈现阳电性，它通常会比阴离子或非离子型聚丙烯酰胺分子量低，其澄洁污水的性能主要是通过电荷中和作用而获得。这类絮凝剂的功能主要是絮凝带负的电荷，具有除浊、脱色功能。在酒精厂、味精厂、制糖厂、肉制品厂、饮料厂、印染厂的等废水处理中用阳离子聚丙烯酰胺要比用阴离子聚丙烯酰胺，非离子聚丙烯酰胺或无机盐效果要高数倍或数十倍，因为这类废水普遍带有阴电荷。
不同的用户现场的水质有所不能，根据水质的特点来选择采用阳离子聚丙烯酰胺、阴离子聚丙烯酰胺、还是两性离子聚丙烯酰胺等，然后通过小试确定适合客户现场使用的型号，这样可以用更小的加药量达到客户处理要求。因为PAM本身生产成本就高，对于水处理行业应用的同时也大大的提高了使用成本。但是产品的投加量少，效益高，能够快速的呈现效果，既可帮客户提高污泥污水处理的效率又可以降低他们的适用成本。所以正确选用聚丙烯酰胺型号是关键。